荒川放水路とそれに近接する隅田川の岸で、男性のバラバラ死体が発見された。だが頭部がなく、被害者の身元が特定できなかった。その後、死体が入っていたと思われる黒いゴミ袋の中から文字と数字が書かれたメモが見つかる。十津川警部たちは試行錯誤の末、それらは駅名と時刻表と数字だという結論を出す。事件の真相はいかに。